二級生物安全柜分A型和B型兩種。A型允許經高效過濾的空氣排入實驗室內，循環使用，因此只能進行無揮發性毒物和無放射性微生物的操作。B型有硬管道連接負壓排風系統，為全排風式。 安裝生物安全柜時應符合下列規定： 1、生物安全柜在安裝搬運過程中，嚴禁將其橫倒放置和拆卸，宜在搬入安裝現場后拆開包裝。 2、生物安全柜放置地點應遠離灰塵多的高速公路區和震源。 3、生物安全柜應放在遠離人員活動、物品流動、門以及窗等可能會擾亂氣流的地方。在生物安全柜后面、左右各留30cm空間，上端留30~50cm空間，以便于維修和更換濾膜。 4、生物安全柜的排風管道的連接方式，必須以更換排風過濾器方便為原則。 5、安全柜不能安裝在房間通風系統的，以免氣流直接吹到安全柜正面的操作口和排風過濾器上。 6、生物安全柜安裝位置未指明時應避開人流頻繁處，并避免房間氣流對操作口空氣幕的干擾。 二級生物安全柜必須進行現場安裝，并符合下列規定： 1、接地裝置的接地線路電阻試驗，應確認接地的分支線路在接線及插座處的電阻不過規定值。 2、壓力滲透試驗，應確認所有接縫的氣密性及整個設備沒有漏氣。 3、洗滌盤漏水程度試驗，應確認盛滿水的洗滌盆經過1h后無漏水現象。 4、高效過濾器的滲透試驗，應確認高效過濾器本身其安裝接縫處沒有滲漏; 5、操作口負壓試驗，應確認通過整個操作口的氣流流向均指向柜內; 6、操作區氣流速度試驗，應確認整個操作區的氣流速度均滿足規定要求; 7、生物安全柜在正常使用過程中，每年要檢驗一次。
